蛋白中鉴定检测方案(液相色谱仪)

蛋白质组学研究是系统式鉴定、定量蛋白质，并全景式研究蛋白质功能的学科。随着学科的进步，对于自下而上（Bottom-up）蛋白质组学的分析深度的需求不断增加。蛋白质组学的分析深度可显著影响人们对于生理、病理过程的理解，以及影响早期诊断的生物标志物的发现等领域，而随着精准医学等应用方向的研究不断深化，则需要更高灵敏度更高分辨率的分析手段。在蛋白质组学的发展历程中，基于毛细管色谱柱的纳升液相联合高分辨质谱的成功应用，使得蛋白质组学研究以超高的灵敏度、极小的上样量为其特点而著称，可在质谱端获得几千甚至上万蛋白的鉴定深度。这些优异性能也极大的拓宽了蛋白质组学技术在生命科学领域的应用范围。在反相液相色谱的分析中，为实现对较低丰度多肽的鉴定，通常需要使用更长的色谱柱以提供更高的色谱峰容量，而较长的色谱柱也对于色谱耐受压力提出了更高的要求[1-2]。本文我们以全新一代可耐压1500 bar的Vanquish Neo UHPLC 液相色谱搭载Orbitrap Exploris 480高分辨质谱仪，测试了不同长度的色谱柱在不同梯度内对Hela细胞裂解液的鉴定能力，同时也考察了全新的FAIMS Pro Duo在此色谱-质谱组合中的鉴定提升能力。