Seer 公司 Max Mahoney：高深度无偏蛋白质组学新技术，开启肿瘤早筛新纪元

　　蛋白质组学的发展方兴未艾，是后基因组时代重点关注的热点领域，新思路，新技术层出不穷，应用领域和场景不断拓展。Seer公司就是在这种大背景下诞生的一家科技新锐，为全球同行开启了一扇通向——大规模，高深度，无偏蛋白质组学的大门。本次采访，让我们聚焦Seer公司技术体系在肿瘤早筛领域的应用。

　　Seer公司提供的Proteograph™XT平台利用经过特殊制作的纳米粒子磁珠，在跨数十个数量级丰度之间，非特异性地结合各类蛋白，无需额外去除高丰度蛋白，再利用高性能的质谱技术，达到高精度测量。在兼顾深度，增强蛋白组分析通量的情况下，实现对大规模血液蛋白的可重复性定量分析，创造了无偏差高通量探寻生物标记物的机会。

　　Max Mahoney 是 Seer 公司最早的员工之一，参与设计开发了数个专利的纳米颗粒和Proteograph^TM系统，先后担任全球高级应用科学家、区域商业负责人等职。Max更是助力中国蛋白质组学发展的老朋友。2022年初，在他的中国之行中，见证了Seer公司和应脉医疗“蛋白质组学新技术和应用卓越创新中心”在上海揭幕，全程指导完成了中国第一台、第二台Seer Proteograph^TM 系统的安装、调试、培训、样品测试、质谱检测、数据分析等全部流程。2023年，Max亚洲之行，让我们一起聆听对他的采访。

　　Seer是蛋白质组学行业领头企业，于2020年在纳斯达克上市。作为Seer公司最早的核心员工之一，你能不能简单介绍一下公司及发展历程?

　　MAX：Seer的经历非常传奇，而且方兴未艾。公司成立于2017年，是一家非常年轻的企业。公司的愿景和目标是：推动蛋白质组学发生革命性变革。Seer的设备和检测试剂本身就非常强大，能让人类从前所未有的全新角度理解蛋白质组，所以极具竞争力。2020年12月底公司完成了首台设备的交付及安装。2022年初推出了第一款商业可用的解决方案，不仅限于美国，也在全球市场进行销售。预计在2024年初会有大量成果发表。

　　近年来癌症早期筛查的创新技术飞速涌现，蛋白质组学在癌症早期筛查方面具备怎样的潜力?与其它组学相比有哪些优势?

　　MAX：其实，癌症筛查这个概念已经存在很多年了，但是直到二、三十年前都是被动进行的。意思是，患者感觉身体有异样或者不舒服了才会寻求诊断和治疗。早期癌症筛查的出现从根本上改变了人类对癌症的认知以及后续治疗。随着精准医学的推广，人类终于有能力在疾病最终成型前就检测到它，再针对特定患者类型制定具体的治疗方案。基因组学的发展，实现了海量基因组数据的获得，驱动肿瘤早筛取得前所未有的进步。接下来，蛋白质组学的研究跟基因组学类似，我们已经能够利用海量数据充分理解血清或血浆的蛋白质组，理解器官的蛋白质组。未来，这项技术会从根本上改变我们看待以及管理人类健康的方式。

　　但蛋白质组却会根据身体状况而改变，所以它提供的是一个动态的指标，动态缩影。让大家能实时掌握自己的健康状况。直到5年前，蛋白质组内容的易获得性才得到大幅提升。现在，大规模蛋白质组研究已经不是遥不可及的幻想，已经成为了现实。我坚信，当人类可以彻底了解蛋白质组，我们对于人体健康的认知也会发生根本性变革。

　　2022年9月，应脉医疗宣布在中国市场取得了重大成绩，SEER全球总部与应脉医疗的研发团队合作，成功突破了5,000个血浆蛋白的检测数量。这项成就对于癌症早期筛查会产生怎样的推动作用?Seer在这方面还有哪些战略部署?

　　MAX：首先，无论是对于单一样本还是组群样本，5,000这个数字都是一个巨大的成就。但这还只是刚刚起步。Seer平台潜力无限。通过Seer与应脉的合作，无偏发现蛋白质组学领域的样本数量将持续提升。也许几年之后再回看现在，5,000都显得微不足道。通过赋能以Seer为代表的核心技术，结合后端的质谱检测设备，样本数量会持续增长。而且不仅仅是蛋白质组，像蛋白质存在形式，蛋白质的翻译后修饰，蛋白质间相互作用等其它类型的样本数量都会进一步增长。

　　随着样本数量增加，人类对于生物复杂性的理解也会被刷新，未来进展本质上将取决于对数据的利用能力。生物知识已经有了，问题是怎么能更容易地获得内容，这也是Seer和应脉医疗合作要解决的问题。在5,000蛋白质样本的基础上，通过大规模研究，这个上限会不断突破，7,000，1万，甚至2万，数据库正在不断扩充。

　　Seer产品的技术原理是什么?如何助力科研人员打通痛点难点?

　　MAX：Seer是基于沃尔曼效应(Vroman Effect) 对蛋白冠加以利用，Seer采用多种纳米颗粒，用不同颗粒形成不同蛋白冠，以此获得信息，达成新的生物学见解。

　　近年来，新的蛋白质分析技术不断涌现。Seer的技术受到高度关注。Seer的独特优势在于何处?

　　MAX：优势很多。首先就是无偏检测平台。这是种基于理论假设的研究方式。研究人员不需要知道目标蛋白质或目标肽就可以进行研究。传统的定向研究法要求必须对研究对象有一定的假设，或有一定的背景知识。相比之下，Seer技术使用纳米颗粒为基础的无偏平台，对蛋白质组的动态范围进行全范围取样。不但能了解与你所研究的疾病相关联的已知信息，更重要的是能发现从未与任何疾病建立联系的未知新信息。而且这些发现的前提是，不需要知道筛查目标的机制或生物学原理。我们的平台是一个真正的发掘性平台，一个真正能为研究人员赋能的发现工具。

　　Seer技术的第二大优势是对检测样本的物种和样本类型不加区分。也就是说，检测对象适用于任何生物体液。血浆、血清、脑髓液、尿液、条件介质等各类生物体液与Seer技术的纳米颗粒组合都兼容。检测对象也不限于一个物种，不限于人类。猪、老鼠的血浆跟人类很相似，都可以作为样本物种或样本类型。Seer平台的无偏发现特质，与多物种、多类型体液取样能力相结合，一定会成为改变游戏规则的核心技术，助力全球的研究人员和企业。

　　Seer的ProteographTM是一个高创新、全自动化的系统，这款产品的特征是什么?临床上的主要应用是什么?

　　MAX：Seer作为一个高端平台，提供的是一个真正的终端到终端的解决方案。

　　自从Seer进入中国市场以来，很多科学家对它产生了极大的兴趣。现在公司也正在推出新产品。新产品有什么新特征呢?

　　MAX：Seer的最新产品Proteograph XTTM十分值得期待，是基于近年来的客户反馈完成的。在保留了之前全部优势的基础上，通量提升2.5倍，综合成本进一步下降，对于大队列客户更加友好。

　　只要Seer这家公司还存在一天，研发就是我们的立身之本。我们推出第一款商业可行的解决方案后，一直在收集客户反馈，开发最新产品。现在我们非常期待在中国市场推出最新产品。