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CYTO2022参会随笔|高内涵流式、微流体技术等新趋势新挑战!

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分享: 2022/07/15 16:15:22
导读: 作为疫情后的第一场线下会议,CYTO 2022获得了同行们的极大关注,也集中展示了近三年来、特别是疫情背景下流式产业新的发展趋势。

仪器信息网#直击CYTO2022#话题(点击查看)

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本文作者:赵精晶

赵精晶博士毕业于清华大学精仪系尤政院士课题组,现为斯坦福医学院结构生物学系博士后,从事高内涵影像光谱流式细胞仪和光学相干层析成像技术(皮肤癌与脑成像)研究。于2021年荣获ISAC发明家称号,致力于便携式流式细胞仪的研发,愿景是为任何人在任何时间和任何地点提供专业的流式检测,实现分子级别的免疫、癌症、血液随身检测。并为cytometry part a注册审稿人,isac innovation council成员,cyto 2023会议执委会委员。

 我与CYTO2022 

作为疫情后的第一场线下会议,CYTO2022获得了同行们的极大关注,也集中展示了近三年来、特别是疫情背景下流式产业新的发展趋势。我是在2017年清华读博时第一次参加CYTO年会,当时中了两个张贴报告,并获得一个最佳张贴。而后,每年都参加CYTO年会做口头或张贴报告,并于2021年获评ISAC发明家奖,担任《Cytometry Part A》注册审稿人。我的研究着重于流式技术和医学影像,特别是微纳系统和高内涵成像技术。

本文看法难免受制于自身眼界、以至偏颇,但望抛砖引玉,为流式界朋友分享一些个人观点。

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大会报告

 1.新趋势与新挑战 

1.1高内涵流式:影像,光谱,多组学。

如果说拓展了荧光维度信息含量的光谱流式可被称为高内涵流式的一次重大技术突破,那么将荧光显微技术和流式技术相结合的影像流式则可被称为流式技术上的一次革命。细胞的形态学信息(特别是分子影像)是众多研究和临床分析诊断的金标准,但传统显微分析在具有高空间分辨率优势的同时还有低通量的不足。影像流式则将一方面赋予了流式媲美显微镜的空间分辨率,另一方面保留了流式高通量和多通道并行检测的优势。市场上最早的影像流式是采用时间积分CCD的Amnis;今年BD隆重推出的FACSDiscover™ S8 Cell Sorter(The first image-enabled spectral cell sorter)无疑是本届展会上的闪耀焦点,证明了影像对于单细胞分选的独特作用(Schraivogel, Daniel, et al. "High-speed fluorescence image–enabled cell sorting." Science 375.6578 (2022));脱胎于加州伯克利Ghost Imaging技术、已融资4500万美元、入围今年CYTO TechShow前三甲的的Thinkcyte公司,讲的也是类成像分选流式的故事(Ota, Sadao, et al. "Ghost cytometry." Science 360.6394 (2018));同时,东京大学Goda教授组也是影像流式领域的先驱;此外,今年展会上还出现了一大批基于面阵传感器的影像流式公司,参见附表。可以预期,未来围绕影像流式将诞生一大批新的算法、试剂和应用。

光谱技术已经成为了今年CYTO年会的主流,围绕此展开的数据分析、应用研究不胜枚举,最为典型的便是会上颁发的2020年Cytometry Part A最佳文章"OMIP‐069: Forty‐color full spectrum flow cytometry panel for deep immunophenotyping of major cell subsets in human peripheral blood"。光谱技术的大量应用随之带来的问题有二:一是如何能够从根源上解决光谱重叠的问题,发展出超窄波的荧光试剂(今年TechShow前三甲的入围者LASE Innovation所研发的laser particle给我们提供了一个很好地思路,可以实现小于1nm的bandwidth,不足是laser particle尺寸在微米量级);二是如何能够有效且准确的理解高维数据,例如通过t-SNE(t-distributed stochastic neighbor embedding, t-随机邻近嵌入)无需圈门地对数据降维、可视化、分群,但如何从生物和医学的意义上对应分群信息亦是极具挑战性。

高内涵流式的另一个发展趋势是多组学融合,在一台流式仪器上(或以流式为核心)完成对单细胞的蛋白组学、转录组学、基因组学、代谢组学等的检测。本届展会上有若干家试剂公司推出了相应的检测试剂。同时,如何针对具体问题用跨组学的手段解析数据将会是多组学检测的一个挑战。有时,多组学检测需要多次或跨平台、大批量地对确定单一细胞进行检测,因而单细胞标记技术也会是一个新的需求(如Barcodes试剂),这也是LASE Innovation的主要应用场景。

1.2 空间组学(Spatial biology)

与以往CYTO年会不同的是,今年流式年会展会上涌现了很多空间组学的公司,既包括老朋友质谱流式成像流式IMC,也包括近来大热的10x(基因与转录)和Akoya(蛋白)。流式与空间组学处理的基本单元都是单细胞,都具有高内涵的特点,但流式的高通量优势依然是空间组学设备所无法比拟的,而空间组学所展现的组织切片中细胞间的空间组织和沟通信息也是流式所无法提供的。空间组学与流式的联合使用能否为病理分析和基础研究提供新的手段将会是一件值得关注的事情。此外,与光谱流式类似,如何能够有效且准确的理解高维数据、如何通过窄波试剂实现更多通道的并行检测同样是值得探索的问题。

1.3样品预处理

今年CYTO展会的另一大亮点是专用的样本预处理设备,涉及样品提纯、清洗等方面,具体手段包括磁分选、声波聚焦、低速离心、循环沉淀清洗等方法。流式样品的标准化、批量化处理设备不仅能够降低人为误差,也能够提升检测的稳定性和准确性,有利于建立标准化的流式检测流程。

1.4微流体技术

微流体技术如今已经成为了流式领域中的常客,被广泛应用于分选、聚焦、预处理等流式分析的各个环节。早期的成功案例包括Nanocellect的微流体压电分选流式、Owl biomedical的微电磁开关分选芯片(2013年被美天旎收购)等。近年,微流体技术从学术界向工业界转产的速度显著提升,例如今年展会的热涡流分选技术(Cellular Highways公司)和TechShow状元Scribe Biosciences的免疫治疗单细胞研究平台(https://www.scribebiosciences.com/)。微流体技术主要解决的微流道的集成和单细胞操控,可以期望未来微光学技术能够从集成光学器件的角度进一步提升系统的集成度和稳定性。

 2. CYTO技术秀(TechShow)

TechShow是CYTO年会的例行活动,旨在为初创企业或创业中的科学家提供一个全球性的专业平台以展示其创新产品(或概念)。单细胞分析领域中,年收入小于1000万美元的企业,或能提供创新商业/产品概念的科学家均可申请参评。作为ISAC Innovation Council成员,今年我有幸全程参与了TechShow的评选。入围最终展示的三家公司分别是单细胞分析平台Scribe Biosciences(https://www.youtube.com/watch?v=6EgXblxFZH0&list=PLrdsTpLbKo29LWH3WZQ8zYDdehnBdP2XH&index=11)、类成像AI分选ThinkCyte和单细胞标记LASE Innovation。现场展示后,最终赢家是Scribe Biosciences。希望明年能够看到咱们中国公司申请参评。

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展会一角

 3.  国人在流式 

如今,可喜地看到越来越多的国人在流式领域展露锋芒,从各大流式平台的主管,到越来越多国人背景的流式公司。与此同时,我们中国人参与ISAC协会运营的人数还非常少。希望我们的流式界朋友能够积极申请ISAC领导力计划。该计划旨在全球范围内发掘并培养未来的ISAC领导者,具体包含三个项目,ISAC发明家(Innovators)、Marylou Ingram学者(Marylou Ingram Scholars)和共享实验室新兴领导者(Shared Resource Lab Emerging Leaders),分别针对于流式技术发明、流式科学研究和流式共享实验室。

今年流式年会后,孙大千老师、范晓轩老师、张千君老师和我一同做了场名为“带你走进流式年会”的直播,文中有些观点亦受到启发,在此予以说明并致以谢意。同时,附上我整理的今年流式展会上印象较深的创新公司或产品,受精力所限未能全部予以归列,还望海涵。最后,祝我们流式界朋友科研、事业蒸蒸日上,愿我们能早日成为国际流式界的中流砥柱。

附表 CYTO 2022展会中印象较深的公司和产品(个人观点,难免偏颇)

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第一视角看CYTO2022大会:创新流式细胞分析/分选技术百花齐放——罗敏

关于中国流式小组【The Cytometry Society, China】

中国流式小组是国际流式学会(ISAC)协助组织;致力于凝聚中国流式人,构建交流沟通的学术平台,成为 中国和国际流式学术组织之间的连接窗口;开展流式学术会议及培训;宗旨是人人参与,人人受益,让它成为我们所有中国流式人自己的家。

  (本文编辑:刘立东)

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[来源:仪器信息网] 未经授权不得转载

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作者:赵精晶

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网友评论  1
全部评论(1条)
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1232022-07-18 06:16:17
了解一下啊
2回复
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