一步式染料法qRT-PCR试剂盒
产品及特点本产品是基于荧光染料检测的即用型 RT-PCR 试剂盒,可以对靶 RNA 分子进行实时定量RT-PCR 分析(quantitative RT-PCR、qRT-PCR)。产品含有经过优化的缓冲液组分、逆转录酶、热启动 Taq DNA 聚合酶、Taq DNA 稳定剂、dNTPs、MgCl2和稳定剂等所有实时定量 RT-PCR 所需要的成分,用户只需加入 RNA 模板和引物即可进行染料法实时定量 RT-PCR反应,具有广泛的用途。本产品具有下列特点:
1. 以 2×Mix 提供,用户只需准备模板、引物和 ROX 染料(取决于 qPCR 仪器)即可以进行染料法实时定量 RT-PCR 实验,非常方便快捷,降低了操作误差。
2. 各成分的浓度和比例都经过精心优化,反应的灵敏度高,特异性强。灵敏度最高时可以达到 50 拷贝/反应(跟模板质量,引物设计等相关)。
3. 灵敏度和专一性比常规 RT-PCR 更高。
4. 可用于基因表达分析、SNP 分析、拷贝数分析等实验。也可以用于定性检测。
5. 本产品只能用于科研,1mL 足够 100 次 20uL 体系的染料法 qRT-PCR 反应。
规格及成分 成 份 编 号 塑料袋包装
2×染料法 qRT-PCR 缓冲液 190102a 500 uL(橙色盖)
10×染料法 qRT-PCR 酶混合液 190102b 100 uL(红色盖)
使用手册 190102sc 1 份
运输及保存 低温运输,-20℃保存, 不冻融时保存期限为 12 个月。如果需要每天使用,可在 4℃放置三周。
自备试剂 RNA 模板、引物、超纯水。
使用方法
1. 如果有 N 个样品并且做定量分析,最好设置 N+7 个反应,多出的 7 个中,6 个是做标准曲线的阳性对照,一个是阴性对照(NC)。在 N+7 个 PCR 管中,加入下列成分。如果是做定性分析,则 6 个做标准曲线的样品缩减成一个阳性对照(PC),用户自己需要根据下
表进行适当修改(把 6 个标曲
自备 50×ROX I 染料
或
自备 50×ROX II 染料(见注)
各 0.4 uL 各 0.4 uL 0.4 uL
10×染料法 qRT-PCR 酶混合液 2 uL 2 uL 2 uL
补超纯水到 20 uL 20 uL 20 uL
注,下列信息仅供参考,具体以 qPCR 仪器的使用手册为准。
1、不需要 ROX 的机型:Agilent MX3000 和 MX4000、iCycler IQ、LightCycler 480、,、Smart Cycler System、Thermal Cycler Dice Real Time System 等型号的荧光 PCR 仪器不需要加 ROX 染料,但加入的话也不会影响整个 PCR 分析。
2、需要使用 ROX I 的机型:ABI Prism7000、7300、7700、7900HT、Step One、StepOne Plus。
3、需要使用 ROX II 的机型:ABI Prism7500、7500 Fast、MJ Opticon、MJ Chromo4、Corbett RotorGene 3000。
2. 放入荧光 PCR 仪中进行扩增, 下表的扩增参数仅供参考,一定需要根据靶分子长度,引物的 Tm 值等进行调节。一般选择三步法 PCR:
步骤 反应参数 备注
逆转录(RT 步骤) 94℃ 30 分钟
预变性 94℃ 2 分钟
PCR(35-45 次循环)
94℃ 15 秒
55-65℃ 15-30 秒
在此步采集 FAM 通道的
荧光信号
72℃ 30 秒
如果引物 Tm 值接近 60℃,也可以选择两步法 PCR:
步骤 反应参数 备注
逆转录(RT 步骤) 94℃ 30 分钟
预变性 94℃ 2 分钟
PCR(35-45 次循环)
94℃ 15 秒
60℃ 30-60 秒
在此步采集 FAM 通道的
荧光信号
3. 数据处理如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct 值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品 DNA 浓度的 log 值,再推算出其浓度。如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性。一般情况下,阴性对照 Ct 大于或等于 40(阈值需要以阴性对照的 Ct 值确定,此处为便于叙述以 40 为例,具体情况很可能阈值不一样)。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小于或等于 30。对待测样品,如果其 Ct 大于或等于 40 则为阴性,如果小于或等于 35 则为阳性。如果在5-40 之间,则重复一次。重复实验的 Ct 值如果大于或等于 40 则为阴性,如果小于 40,则为阳性。