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技术篇|信号肽的秘密

沪震生物

2022/06/24 13:20

阅读:29

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定   义

信号肽是引导新合成的蛋白质向分泌通路转移的短(长度5-30个氨基酸)肽链。


发   现

1972年Milstein等发现免疫球蛋白IgG轻链的前体要比成熟的IgG在N-端多20氨基酸。他们推测这20个氨基酸可能和其通过ER进而分泌有关。美国Bloble实验室完成三项重要的实验支持了以上推测:

  1. 将IgG的mRNA在无细胞系统中,以游离核糖体体外合成时产生的蛋白是IgG的前体;若在无细胞系统中加入狗胰细胞的RER,就能产生IgG成熟蛋白。成熟的IgG轻链蛋白和前体蛋白相差的20个aa是疏水性很强的氨基酸;

  2. 加入蛋白水解酶不能使正在合成的IgG水解,而同时加入去垢剂就可以使其水解。由于蛋白酶只能作用于游离的蛋白而不能作用与膜结合的蛋白,所以表明IgG合成可能和RER的膜是结合的,而用去垢剂可将其和膜分离才得以水解;

  3. 用去垢剂处理骨髓瘤后所获得的多核糖体与膜分离,然后在离体的条件下继续进行新生肽的合成。经短时温育得到的是成熟的IgG,而长时温育得到的是前体IgG,此表明mRNA5’端核糖体上合成的新生肽尚未来得及加工,而在3′端核糖体上合成的新生肽在核糖体未分离前已部分进入rER,经过了加工,切除了N-端的部分。

在以上实验的基础上Bloble和Dobberstin(1975)提出了信号假设(signalhypothesis),认为分泌蛋白N-端有一段信号肽,当新生肽长约50-70aa后,信号肽从核糖体的大亚基中露出,立即被RER膜上的受体识别并与之结合。在信号肽越膜进入RER内腔后被信号肽酶水解。正在合成的新生肽随着信号肽通过RER膜上的蛋白孔道穿过脂双层进入RER腔内。这一假设经过多年的继续研究又有了新的发展,但基本观点仍是正确的。Bloble因这项成就而荣获了1999年度诺贝尔生理学或医学奖。



结    构

信号肽位于分泌蛋白的N端。一般由15~30个氨基酸组成。

包括三个区:

一个带正电的N末端,称为碱性氨基末端:

一个中间疏水序列.以中性氨基酸为主,能够形成一段d螺旋结构,它是信号肽的主要功能区;

一个较长的带负电荷的C末端,含小分子氨基酸,是信号序列切割位点.也称加工区。

当信号肽序列合成后,被信号识别颗粒(SRP)所识别,蛋白质合成暂停或减缓,信号识别颗粒将核糖体携带至内质网上,蛋白质合成重新开始。在信号肽的引导下,新合成的蛋白质进入内质网腔.而信号肽序列则在信号肽酶的作用下被切除[21。如终止转运序列存在于新生肽链的C端.也可以不被信号肽酶切除.如卵清蛋白含有内部信号肽。它的前体与成熟形式都没有被信号肽酶切除的过程.其N一端氨基酸结构在第9位有带电基团,疏水结构并不明显。

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应   用

随着对生物疗法和重组蛋白的需求日益增加,一些原核和真核宿主已被广泛用于表达重组蛋白。然而,重组蛋白的大规模生产存在一些障碍,其中包涵体的形成和蛋白酶降解蛋白质是重要因素。另一方面,内源性蛋白可能会干扰重组分泌蛋白的折叠。上述因素以及复杂的蛋白生产的下游纯化过程,都会导致蛋白产量的损失。而且,重组蛋白的产量不仅与表达水平有关,还与转位效率(translocation efficiency)有关。分泌机制和信号肽,决定了转位的能力和效率。利用来自异种的替代信号肽可以提高转位效率。研究表明,信号肽的使用将蛋白质产量提高到具有商业意义的水平。

除了重组蛋白的生产外,信号肽在其他方面也具有特殊的重要性。在枯草芽孢杆菌的胞外蛋白中,大约50%的蛋白质含有典型的信号肽。大肠杆菌中90%以上的分泌蛋白依赖于信号肽。大量的真核生物分泌蛋白(占小鼠和人类蛋白质组的20%以上)也含有信号肽。不同类群中信号肽所占比例较大,说明了其研究意义。此外,大量的人类疾病是由信号肽突变引起的。


功   能

SRP(信号肽识别粒子)有三个重要的功能:

(1)它能和新生的分泌蛋白的信号肽相结合;

(2)还能和位于膜上的蛋白受体相结合;

(3)延伸制动。

SRP活性能在体外由单个成分获得再生。其实有功能的SRP可由一种7SRNA和其它一些蛋白组装而成。像其它转运和跨膜蛋白一样,SRP普遍存在于真核生物中。

SRP和SRP受体二者的催化功能是将带有新生肽的核糖体转移到膜上。di一步是信号肽被SRP识别。然后SRP和其受体结合,核糖体结合到膜上。SRP受体在蛋白质转运中的作用是短暂的。当SRP和信号肽结合时,它阻止了翻译。蛋白合成停止。这是在新合成的多肽链长70aa左右时发生的。(这样25-30残基的信号肽伸在核糖体外面,相邻的约40个aa仍在核糖体中)。

当SRP与其受体结合时,SRP释放出信号肽,然后核糖体和膜上的其它成分(尚未鉴别出)结合,此时翻译得到恢复。当核糖体被传递到膜上时,SRP及其受体的作用已完成了,又进入新的循环。再自由地发动另一些新生肽和膜的结合。

此SRP7SRNA可分成两部分:5′端的100个碱基和3′端的45个碱基,这一段和AluRNA顺序密切相关,因此定义为Alu结构域(Aludomain)。RNA余下的部分由SRNA功能域(sRNAdomain)构成。

RNP不同的部位对于靶蛋白具有相应三种功能。在体外用SRP的识别来研究每部分的功能。54KDa的蛋白只有一个分子,它不直接和RNA结合。而是和19KDa的蛋白结合,19KDa蛋白与RNA的两个未端结合。P54用来识别信号肽;P68/72双体结合于RNA的中心区域,它是用来识别SRP的受体及蛋白的越膜转运。P9/14二聚体结合在此RNA分子另一端的附近。它负责延伸制动。

SRP的受体是含有72Kda和30KDa两个亚基的二聚体。大亚基的N-端锚定在ER中,蛋白的大部分伸在胞液中,蛋白的此区域的大部分顺序与核结合蛋白相似,带有很多正电荷的aa,表明SRP受体识别SRP中的7SRNA。

为什么协同翻译的蛋白进入内皮网状系统,而翻译后转运的蛋白就要进入线粒体和叶绿体呢?还没有充分的证据来明确回答此问题,且在酵母中输入ER的蛋白却发生在翻译后转运,这使问题更为突出。两种过程对能量的需求是不同的。转运到线粒体或叶绿中需要一种电位差,而进入ER时需ATP。这并不意味着蛋白系统的作用涉及到能量的提供。核糖体的存在对于在协同翻译转运中维持蛋白进入膜中时的正确几何形状是需要的。



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