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Voice of Customer|利刃出鞘!齐碳纳米孔基因测序平台助力山东公卫应对感染防控重大挑战

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分享: 2023/11/27 09:24:36

目前,肺炎克雷伯菌在全球范围内造成了临床和公共卫生威胁。耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)有“超级细菌之王”之称,属于“革兰阴性菌”。碳青霉烯类抗生素具有强大的抵抗力,被称为“人类抵抗细菌的最后一道防线”。


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由于大多数抗生素都是广谱药物,可以对抗多种细菌,因此对很多类型的细菌施加了很大的选择压力,导致细菌迅速进化,并能获得耐药基因。


而质粒编码的众多抗菌素耐药性(AMR)毒力因子会增加肺炎克雷伯菌感染的严重程度,并且耐药基因水平传播会导致革兰阴性菌耐药性的快速出现和散播。而近年来,新型抗生素的储备似乎已经跟不上细菌进化的速度。


因此,规范的感染性疾病精准检测,尤其是对病原体的精准分型以及耐药性评估显得至关重要!

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近日,山东省公共卫生临床中心引入国内首个自主研发的纳米孔基因测序仪——齐碳科技QNome平台,并基于该平台对6例菌株样本进行基因组测序分析,不仅快速完成了样本中微生物的检测鉴定,获得了高质量测序数据,还成功检出所携带的耐药基因。

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明显区别于目前主流的病原菌药敏试验(AST)和受读长限制的传统基因测序技术,纳米孔基因测序技术长读长的特点,在耐药基因的发现和识别、进化和传播特征分析等研究工作中具有突出优势。


依托于纳米孔测序技术长读长的优势,在进一步的测序数据分析中,研究人员构建了6个样本的基因组完成图组装(组装N50均达到了5.2Mb以上),不仅得到了闭合环形完整的肺炎克雷伯菌基因组的圈图,还在组装序列集中发现了多种携带的质粒,并组装得到完整质粒圈图。

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高质量的组装结果帮助提示样本来源可能存在耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌的感染,为临床治疗以及抗生素耐药性研究提供了更多科学的参考信息,充分展示了齐碳纳米孔测序平台在病原微生物快速鉴定中的灵敏性和抗生素耐药性研究上的应用潜力。


研究小组人员感叹道:“作为全球最新的基因测序技术,没想到第一次上手就如此顺畅,切实体验到了实时测序的便捷性。并且,不同于传统培养法耗时长、结果稳定性不易控,纳米孔测序不仅耗时短、准确性更高,还帮助我们更深入获得样本的基因信息”


山东省公共卫生临床中心整合与转化医学中心于兆衍主任对此次齐碳科技纳米孔测序平台在测序稳定性、速度和检测灵敏度方面的表现非常满意,并评价道“齐碳自主研发的纳米孔测序平台充分展示了新一代基因测序技术的可用性与易用性,特别是能检测出重点的耐药基因这点超出我的预期,我十分看好这项技术未来在临床科研应用方面的巨大潜力。” 

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随着分子诊断技术的不断成熟、应用以及微生物基因检测产业的快速发展,基因测序技术被应用于测定微生物基因组序列,进一步拓展了耐药检测的能力。


基于齐碳纳米孔基因测序平台进行的微生物检测,不仅能提高检测灵敏性、特异性,缩短报告时长,大大降低纯培养细菌和宏基因组学样品序列组装的复杂性,还可轻松跨越复杂结构区域,研究针对性强且所需数据量少,不仅能够有效鉴定结构变异,帮助更轻松、系统地解析质粒、整合性接合元件(ICEs)等可移动基因元件的序列信息,深入了解耐药基因的基因水平转移,获取更加完整的信息,开拓更广泛的应用空间。  




作为基因测序仪上游企业,齐碳科技希望能为科研、临床环境等提供新的工具和思路,为生命科学及相关领域的研究与应用提供更便捷、高效的解决方案。


基于齐碳QNome测序平台,纳米孔单分子测序技术应用于病原微生物快检与耐药性等微生物研究领域的合作文章已陆续发表。


【点击查看齐碳科研动态】





*齐碳科技纳米孔测序平台为科研级产品,仅供研究使用,不得用于诊断治疗。

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2021年12月,齐碳科技通过5年的自主研发,成功推出国内首台商业化的纳米孔基因测序仪QNome-3841,并宣布首个生产基地竣工,正式开启纳米孔基因测序国产化时代。2022年6月,齐碳科技发布纳米孔基因测序仪QNome-3841hex,标志着国产纳米孔基因测序仪开始了矩阵化发展,这也为灵活测序场景提供全新的解决方案,将更好地满足市场应用的多元需求。


2023年8月,齐碳隆重推出自主研发的中通量纳米孔基因测序平台QPursue,该平台涵盖纳米孔基因测序仪QPursue-6k和QPursue-6khex及其配套芯片QCell-6k,代表着国内纳米孔基因测序技术的最前沿水平,标志着国产纳米孔基因测序仪向中高通量进阶。

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齐碳秉承从上游推动行业发展的理念和对前沿技术的探索精神,保持开放、合作的态度,期待和产业同仁携手共进,探索国产纳米孔基因测序技术在多场景中的优势和广阔的市场前景,构建纳米孔基因测序的生态平台,共同为中国医疗健康事业的稳健发展贡献智慧和力量。

[来源:成都齐碳科技有限公司]

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