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MinION:把基因测序仪揣在口袋里,想测就测

仪器信息网 2014/09/26 09:58:06 点击 890 次
默克工艺
[导读] 由英国Oxford Nanopore公司开发的,仅4英寸长、普通U盘大小MinION测序仪日前投入市场。它的出现或颠覆整个基因测序行业,MinION测序仪仅售900美元。

  今年年初illumina公司的CEOJay Flatley在摩根大通健康会议上信心满满地发布了两款测序仪,尽管在基因测序的通量和速度方面,新仪器Hiseq X Ten比其以往的测序仪更具优势,但是昂贵的价格却让很多大公司囊中羞涩、望洋兴叹。而一款仅售900美元的测序仪很可能让illumina公司感到坐立难安,同样感到紧张的还有CG测序仪的拥有者们,因为他们的测序仪重达数吨,而且平均读长仅有36bp。

  由英国公司Oxford Nanopore开发设计MinION测序仪则拥有很长的读长,而且只有普通U盘大小,可随身携带,理论上可实现想测就测。日前该测序仪已投入市场使用,或许未来它将基因测序仪变得如同手机一样普通、便捷、廉价。

  MinION测序仪的测序原理

  MinION测序仪只有4英寸长,普通U盘大小,由一个传感器芯片,专用集成电路和一个完整的单分子感应测试所需的流控系统构成。MinION采用新型纳米孔测序法(nanopore sequencing),拥有很长的读长,平均读长为80K bp,并且具备很高的测序速度。

  然而,目前纳米孔测序法较低的测序准确率65%-80%仍是大家关心的问题,但是该设备目前仍在不断更新,仍有很多研究者非常看好这一技术,“数年后,它会主导基因测序市场”。同样该技术被MIT Technology Review杂志评为“2012年10大年度科技突破之一”。制药巨头Roche公司同样看好这一技术,2012年Roche公司宣布基因测序仪454从测序市场退出,但它们并没有放弃测序市场,随后它们耗费1.25亿美元收购了纳米测序技术公司Genia Technologies,以及投资了Stratos Genomics公司。

The MinIon USB gene sequencer, plugged into a laptop

  MinION测序仪售价仅为900美元,相比那些5 万美元到 75 万美元的基因测序设备,这种基因测序仪未来将会赢得更多的市场。你完全可以将其揣在口袋里,随时随地的测序自己的基因,但基因测序的数据分析则需要运营能力强大的电脑以及专业人士来解读。

  尽管如此,但是它的出现将会改变目前基因测序领域的游戏规则。大型基因测序仪器设备商以及基因测序服务公司的日子将会变得窘迫起来,因为人们将不再需要他们的设备、仪器和服务,另外基因测序解读公司可能会火起来,因为庞大的基因测序数据需要更多的公司来完成基因解读的任务。

[来源:生物探索]  
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编辑: 秦丽娟
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