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【文献速递】转录因子JUN介导的seRNA形成R环促进鼻咽癌转移
增强子是DNA远端元件，在细胞类型特异性生物过程中可激活或增加相关基因的转录。转录因子 (TF) 通过特殊的识别序列与这些增强子结合，并与辅助因子合作，在增强子和启动子之间形成染色质环。据报道，超级增强子（SEs）是一系列增强子，也被称为伸展增强子，存在于对细胞存活和肿瘤发生至关重要的基因附近，通过激活邻近基因促进致癌过程。增强子（SEs）连接若干启动子，通常与其目标基因相距数百个干碱基。与典型的增强子（TEs）相比，增强子含有更大的开放染色质结构域，其特征是高水平的H3K27乙酰化（H3K27ac），并富集用于TEs结合。SEs通常与RNA聚合酶II(RNAPII)结合，产生被称为seRNA的双向非编码RNA。seRNAs或类似seRNA的非编码RNAs的缺失会导致与之相关的蛋自编码基因下调， seRNAs在肿瘤发生中发挥着重要作用。
鼻咽癌（NPC）是一种起源于异咽部、具有高度转移潜力的恶性肿瘤。虽然鼻咽癌对放疗敏感，但远处转移患者的预后仍然很差。1,4-二硝基哌嗪（(DNP）是腌制食品中最主要的挥发性亚硝胺。一些研究表明，DNP可以在体内促进NPC癌变和转移。
在本研究中，证明了一种新的鼻咽癌转移分子机制。采用全局run-on测序、染色质免疫沉淀测序和 RNA测序相结合的方法筛选 seRNA一个与异咽癌转移相关的特异seRNA (seRNA-NPCM）被鉴定为N-myc下游调控基因1(NDRG1）的转录调节因子。已证实主转录因子JUN对激活seRNA-NPCM的产生至关重要。从基因间区转录的seRNA-NPCM可促进鼻咽癌的体外和体内转移。在鼻咽癌患者中，seRNA-NPCM 的表达预示病情不佳。SeRNA-NPCM在SE区域形成RNA-DNA环(R-loops），并与 NDRG1和 TRIB1 启动子上的 hnRNPR结合，从而促进增强子-启动子环形成和基因转录。seRNA-NPCM还与 ACTA1 直接相互作用。这些发现对于阐明 seRNA-NPCM 在鼻咽瘤转移过程中调节启动子的分子机制具有重要意义。
论文链接：
doi.org/10.1038/s41419-023-05985-9
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