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国产基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱系统Clin-TOF-Ⅱ MS与Bruker Biotyper质谱系统在革兰阴性菌的鉴定效能评估

毅新质谱发布时间:2017/03/02 12:57 点击: 加载中..

范欣, 肖盟, 徐志鹏, 张戈,陈欣欣,徐英春. (中国医学科学院 北京协和医学院北京协和医院检验科) 国产基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱系统Clin-TOF-Ⅱ MS与Bruker Biotyper质谱系统在革兰阴性菌的鉴定效能评估 [J]. 中华检验医学杂志,2017,40( 1 ): 41-45. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2017.01.009

 

编者按

北京毅新博创生物科技有限公司是国内首家自主研发临床质谱的企业,也是第一家国产质谱走出国门走向世界的企业。该公司研发的clin-tof质谱系统是国内第一个通过CFDA认证的质谱系统。本文节选北京协和医院检验科徐英春主任最新发表在《中华检验医学杂志》上的研究论文,该研究验证了国产Clin-TOF质谱系统在革兰阴性菌方面的鉴定能力与Bruker质谱系统相当,都有非常好的鉴定效能。

 

该研究旨在评估国产基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱系统Clin-TOF-Ⅱ型仪器及其搭载的BioExplorer V2.3鉴定数据库(简称Clin-TOF质谱系统)对革兰阴性菌的鉴定效能。共纳入1999至2000年及2014至2016年北京协和医院革兰阴性菌1025株,分属32个属,56个种或种复合体。其中,肠杆菌科细菌覆盖13个菌属;非发酵菌覆盖7个菌属;以及其他12个菌属的少见革兰阴性菌。另外,该研究纳入了临床常用的革兰阴性ATCC标准菌株,包括大肠埃希菌ATCC 8739、ATCC35218、ATCC25922、流感嗜血杆菌ATCC 49247、ATCC 49766、铜绿假单胞菌ATCC 27853。对照方法为Bruker Biotyper质谱系统:Bruker Autoflex Speed型号仪器及其搭载的Biotyper v3.1数据库(简称Bruker质谱系统)。采用直接涂抹法平行使用2套质谱系统对研究纳入菌株进行菌种鉴定。结果显示,Clin-TOF质谱系统准确鉴定率为98.05%(1 005/1 025)。该研究表明国产Clin-TOF质谱系统在鉴定革兰阴性菌方面有临床效能。

 

1.鉴定准确性

Clin-TOF质谱系统临床菌株准确鉴定率为98.05%(1 005/1025)。

2.肠肝菌科细菌

对于689株肠杆菌科细菌来讲,包括埃希菌属、克雷伯菌属、肠杆菌属、沙雷菌属、枸橼酸杆菌属、变形杆菌属、摩根菌属、沙门菌属、普罗威斯登菌属、柔特勒菌属、多源菌属等,Clin-TOF质谱系统能够准确鉴定98.98%(682/689)的肠杆菌科细菌。

3.非发酵菌

对于306株非发酵菌,包括假单胞菌属、不动杆菌属、无色杆菌属、窄食单胞菌属、金黄杆菌属、莫拉菌属、产碱杆菌属等,Clin-TOF质谱鉴定系统准确鉴定率达到97.71%(299/306)。

4.少见革兰阴性菌

该研究纳入的30株少见格兰阴性菌,包括苍白杆菌属、伊金菌属、嗜血杆菌属、气单胞菌属、罗尔斯通菌属、勒克菌属、巴斯德菌属等。Clin-TOF质谱系统准确鉴定率为80%(24/30)。

 

Clin-tof质谱系统搭载的最新的BioExplorerV2.3数据库是我国自主研发建立的数据库,因此对我国临床病原菌鉴定有一定的针对性。Clin-TOF质谱系统与Bruker质谱系统的鉴定准确率均为98%以上, 国产clin-tof质谱系统在革兰阴性菌方面的鉴定能力与bruker质谱系统相当,都有非常好的鉴定效能

 

Clin-TOF质谱系统简介

Clin-TOF飞行时间质谱系统由国内首家自主研发临床质谱的企业——北京毅新博创生物科技有限公司生产。该公司的Clin-TOF-Ⅰ质谱系统于2012年即通过了欧盟 CE IVD 认证和美国FDA 认证,2014 年通过中国 CFDA 认证 。Clin-TOF-Ⅱ 临床质谱仪于 2016 年通过欧盟 CE IVD 认证,具有1200mm长度的飞行管,因此,比Clin-TOF-Ⅰ(飞行管长度800mm)具有更高的灵敏度、分辨率和精准度:在蛋白组学、基因组学应用基础上,拓展了微生物组学应用领域,拥有超过370属、2200种、7900株的微生物谱库,可对临床样本或培养后临床样本进行细菌、真菌、分支杆菌鉴定。

Clin-TOF临床质谱仪,在蛋白组学研究方面,可进行生物样品的蛋白、多肽及蛋白糖基化修饰检测,是蛋白组学研究的有效技术手段;在基因组学研究方面,直接以核酸片段的分子量为标记,对核酸进行精确的定性定量分析,适用于各种类型的SNP基因型核酸分析实验,可用于肿瘤ctDNA、药物基因、遗传代谢疾病基因检测。

Clin-TOF质谱系统是目前应用质谱技术对疾病蛋白质组、基因组、微生物组进行全方位研究的先进技术平台。

 

Clin-TOF质谱系统特点

Clin-TOF飞行时间质谱系统具有功能多样及高通量的特点,可实现蛋白质及多肽检测、核酸检测、微生物检测多种功能,且具有快速检测大样本量标本的特点,该系统适合应用于临床检验项目。不同分析目标要求不同的样品处理及研究方法。

  1. 疾病蛋白质组研究:样品(体液/组织/细胞)中的蛋白、多肽提取(液相色谱/固相芯片/液相芯片)质谱检测软件分析图谱多肽鉴定临床模型建立。

  2. 基因组学研究:样品中的DNA提取PCR扩增SAP消化单碱基延伸树脂纯化、上样质谱检测核酸分型。

  3. 微生物组学研究:菌种分离菌种培养样本提取、上样质谱检测微生物谱库检索、鉴定。

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