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注资Stratos Genomics 罗氏再度投身四代测序研发

罗氏诊断发布时间:2014/07/02 16:49 点击: 加载中..

  继2014年5月罗氏收购第四代测序公司Genia Technologies之后,罗氏近期宣布将对Stratos Genomics公司进行策略性投资以及研究上的合作。目前罗氏已投入了500万美元的第一笔资金,支持Stratos公司开发其独特的化学工艺,用于通过纳米孔进行DNA单分子测序。

  与罗氏之前投资的两项单分子测序技术(Pacific Biosciences公司的ZMW技术与Genia公司的Nano-tag技术)不同,Stratos Genomics公司在研发的是一种叫做“边扩大边测序”(“SequencingByExpansionTM”,SBXTM)的技术。

上图为XpandomerTM分子

  该方法将DNA转换成一个更大的“替身”分子,这个大分子被称为XpandomersTM,再通过检测这个“替身”分子来测定原始的DNA序列。这些XpandomersTM大分子,比原始的DNA长10-100倍,由多个“高信号值”的报告分子组成,这些报告分子排列对应原始DNA碱基序列。XpandomersTM分子穿过纳米孔时,不同报告分子产生不同信号而被检测,从而可获得原始DNA序列。XpandomersTM由聚合酶合成,以DNA为模板,利用一种可伸长的特殊核苷酸合成“替身”分子XpandomersTM,再通过一个快速的化学反应拉长“替身”分子的长度,再通过纳米孔进行测序。这种报告分子由于比其对应的碱基分子长10-100倍,可以使得通过纳米孔时所引起的电信号改变更加显著,信噪比更好,从而提高单碱基的分辨率及读取的准确性。

  罗氏一直致力于为所有用户提供前沿的、有别于新一代测序的产品和服务,同时也一直在为基因组领域中测序技术的革新以及临床价值的传递提供解决方案。2007年,罗氏收购了第一家二代测序公司454 Life Science,同年还收购了NimbleGen做为二代测序上游DNA序列捕获解决方案,2013年,与单分子测序公司Pacific Biosciences合力推进单分子测序在临床检测上的解决方案,今年上半年罗氏也宣布收购Genia公司进军四代测序技术。

  在单分子测序方面,Stratos Genomics公司特有的技术能够补充之前投资的两项单分子测序技术,尤其Genia公司纳米孔测序技术可以更好地结合,为更广泛领域的测序应用提供解决方案。罗氏坚信这三种单分子测序技术在诸如成本、速度、准确性及灵活性等方面各有其擅长之处,有望在测序市场引发突破革命。

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