前言
在上期文章中,我们提到了CyBio FeliX基于Cube Biotech NativeMPTM技术的全自动PlateX MPTM试剂盒膜蛋白纯化应用(回看链接:CyBio Felix高效助力自动化细胞膜蛋白纯化),在完成膜蛋白纯化后,可以对纯化后的膜蛋白保存条件、膜蛋白与配体的相互作用等进行分析,常用的分析方式为膜蛋白热稳定性分析,也叫膜蛋白热漂移检测(Thermal shift assay)。
膜蛋白的热稳定性是功能表征、结构解析和药物开发的关键参数,测定溶解温度(Tm)的变化是分析蛋白质热稳定性的经典方法。常用的SYPRO® Orange荧光染料可通过结合蛋白热变性后暴露的疏水区域,实现对蛋白质解折叠的灵敏检测。然而,SYPRO® Orange的本底荧光较高,特别是在膜体系(如脂质体、去垢剂溶液)中容易发生非特异性结合,导致背景信号干扰,可能会因背景噪声导致拐点模糊,难以准确计算Tm值,降低检测灵敏度,因此,SYPRO® Orange染料不适用于膜蛋白的热稳定性检测。
CPM染料(7-二乙氨基-3-(4'-马来酰亚胺基苯基)-4-甲基香豆素),已被证明是一种进行膜蛋白热稳定性分析的更合适的荧光染料,该染料在结合膜蛋白的巯基后,荧光量子产率显著提升,且未结合的染料背景荧光强度极低,信噪比更高,尤其适合低丰度膜蛋白的热稳定性检测。然而,由于CPM染料的激发光波长在近紫外区间,要对其进行有效检测需要检测仪器的光学系统提供近紫外UV-A范围的激发光,同时在其发射光谱范围内进行检测。
德国耶拿公司的qTOWER iris是一款全光谱实时荧光定量PCR仪(图1),配备专用的UV检测通道。结合仪器精确的温度控制,能够满足CPM标记对膜蛋白进行灵敏且可靠的热稳定性分析。
图1. 德国耶拿公司qTOWERiris实时荧光定量PCR仪
在本应用中,利用荧光染料CPM进行膜蛋白热稳定性分析,使用高通量qTOWER iris 384荧光定量PCR仪配备UV通道 (该应用同样适配qTOWERiris 96通量),在不同pH水平和不同盐浓度缓冲液条件下进行检测。
在qTOWERiris 384进行膜蛋白热稳定性分析的优势主要体现在:
1
专用UV-A通道
配备375 ± 15 nm激发光和475 ± 15 nm发射通道的UV通道,完美匹配CPM等UV染料的激发/发射特性;
2
高灵敏度检测
高性能光学系统可检测微小的荧光强度变化,确保对蛋白解折叠过程中细微构象变化的捕捉;
3
精确均一的温度控制
配温度控制精确且均一,温度准确性±0.1℃,温度均一性±0.15℃,可获得可靠的Tm值;
4
384孔高通量能力
在保持数据质量的前提下实现高通量筛选,适合药物发现中的大量化合物评估。
方 法
制备终浓度为0.5 mg/mL的膜蛋白溶液。配置不同条件的NaCl浓度(50、100、250、500 mM)和pH值(5、6、7)(表1),使用qTOWREiris 384荧光定量PCR仪进行测试,体系体积为10 µL,根据图2进行反应程序设置。
表1. CPM样品的制备
图2. CPM热稳定性分析的程序。荧光通过UV模块记录
(激发375 ± 15 nm / 发射475 ± 15 nm,LED增益5)
通过qTOWERiris 384进行CPM标记膜蛋白的热稳定性分析,以评估pH和NaCl浓度对蛋白质稳定性的影响。最终得到图3和图4的结果。
图3. 在qTOWER iris 384上使用UV通道检测不同缓冲pH值(5、6、7)以及
不同NaCl浓度下膜蛋白的CPM信号,计算溶解温度Tm
图4. 不同pH和NaCl浓度下的Tm值
总 结
qTOWER iris系列实时荧光定量PCR仪具有特殊的紫外检测通道,能够快速且精确地评估膜蛋白质热稳定性。实现高效筛选保存条件以最大化膜蛋白质稳定性,并评估小分子化合物、配体等对膜蛋白的影响。高性能光学系统可检测微小的荧光变化,而样品模块精确且均一的温度控制能够获得可靠的溶解温度,同时,搭配的qPCRsoft分析软件中的溶解曲线分析可直接获得Tm值,分析其变化情况,操作快捷方便,协助实验人员快速获得实验结果
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