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“大海捞针”,其实没那么难 ——如何从废水中快速检测新冠病毒

德国耶拿

2021/12/29 11:51

阅读:629

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全球性的新冠疫情已经延续了近两年的时间,多项研究已证明,在新冠肺炎患者排泄物中存在大量病毒基因组,病毒基因最终会混入废水中,这就是基于废水研究新冠流行病学的理论依据。从污水处理厂废水中检测新冠病毒,无异于把大量的城市居民样本进行混检,与实验室的5-10个样本混检相比,废水检测是超级大混检,能为疫情防控提供早期预警,以及病毒的早期溯源,考虑到无症状群体的存在,能将无症状群体纳入监测范围的废水检测显得尤为重要,可以提供更多的更早的溯源信息。


11月传染性更强的新冠病毒变异株“奥密克戎”(Omicron)首次在南非被发现至今,这一变异株已传播到上百个国家,我国也在入境人员样品中检测到了奥密克戎毒株。如何能在早期监测到奥密克戎毒株,尽可能减少其传播的可能,显得尤为重要,而废水检测毫无疑问是一个有效的监控项目。近日,德国慕尼黑一个研究所的科学家在127日采集的慕尼黑废水样本中检测出了大量奥密克戎毒株,这表明这种新的变异新冠病毒早已在当地传播,比在人群中检测到奥密克戎毒株更早。


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污水成分复杂,病毒含量低,对其进行新冠病毒检测无异于大海捞针是个巨大挑战,但如果方法得当,检测手段先进,这大海捞针其实并不难

下面我们一起来看一下,如何从污水中高灵敏度地快速检测到新冠病毒。方案已经成功应用在德国Emschergenossenschaft / Lippeverband水务公司实验室

 

一、 样品采集和富集

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二、 新冠病毒核酸提取

采用自动核酸提取仪InnuPure C16 touch,加上配套的InnuPREP AniPath DNA/RNA kit-IPC16提取试剂盒,无需太多人工参与,可标准化地来快速完成病毒核酸的提取,每份样品的最终产物洗脱体积为100 μl

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三、 荧光定量PCR检测

德国耶拿快速荧光定量PCRqTOWER3G 上来进行新冠病毒核酸检测,如果待检的废水样品很多,还可选择更高通量的qTOWER384来高效完成新冠病毒的检测。

德国水务公司采用的是IDEXX公司的Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test检测试剂盒,耶拿的仪器是一个开放的平台,可匹配国内众多新冠病毒检测试剂盒,其运行速度快,温控精准度好,检测灵敏度高,还能为用户提供标配的中文软件,是检测废水中新冠病毒的重要工具。


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现在全球新冠疫情还未得到完全有效控制,国内疫情也有多点散发的情况,德国耶拿的“从污水中检测新冠病毒的高效解决方案”能为极具挑战性的污水新冠病毒检测带来有力保障,助力新冠疫情的早期预警和溯源监控。


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