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核磁共振技术（NMR）

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主题：请问在蛋白质结构鉴定中，residual dipolar coupling较NOE技术有什么优势？

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brucezheng

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发表于：2005/05/03 18:51:00 楼主管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

好像可以确定几个独立结构域的不同方向，但是具体原理不太懂，请教各位大侠了。另外，residual dipolar coupling中定向介质的选取有什么标准？

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stevexdx

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2005/5/7 15:48:00 沙发管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

RDC(残留偶极耦合)技术是比较新的蛋白质核磁共振谱学的技术，应用于蛋白质的结构测定与结果改进，以及动力学研究等领域。与J-coupling和NOE等蛋白结构测定信息相比，RDC作为一种有效的补充信息，提供了测定蛋白结构尤其需要的长程信息。

不同的定向介质中，RDC的具体数值会有所不同。所以要根据所考察体系的实际情况来选择相应的定向介质，为谱图解析工作提供方便。

以上两点是我的粗陋理解，如果楼主有需要，我会进一步请教实验室里的专家。另外RDC的牛人之一，University of Georgia的Prof. Jim Prestegard 5月23-25日会来我们组参加workshop,届时会做有关RDC方面的研究最新介绍。

最后附上有关RDC在测定蛋白结构方面的综述文献汇总
(Residual Dipolar Couplings in Structure
Determination – Recent Reviews)

Prestegard, A-Hashimi & Tolman, Quart. Reviews
Biophys. 33, 371-424 (2000).

Bax, Kontaxis & Tjandra, Methods in Enzymology,
339, 127-174 (2001)

Tolman, Curr. Opin. Struct. Biol. 11, 532-539 (2001)

Prestegard, Bougault & Kishore, Chemical Reviews,
104, 3519-3540 (2004)

Lipsitz & Tjandra, Ann. Rev. Biophys. Biomol. Struct.,
33, 387-413 (2004)

Fushman et al., Prog. NMR Spect. 44, 189-214 (2004)

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Last edit by stevexdx

brucezheng

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2005/5/16 22:11:00 板凳管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

太感谢了！看了篇相关综述，有些不太懂

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2005/5/18 13:05:00 马扎管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

有兴趣的话，我们可以讨论一下

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spiner

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2005/5/21 3:48:00 地毯管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

原文由 stevexdx 发表:
RDC(残留偶极耦合)技术是比较新的蛋白质核磁共振谱学的技术，应用于蛋白质的结构测定与结果改进，以及动力学研究等领域。与J-coupling和NOE等蛋白结构测定信息相比，RDC作为一种有效的补充信息，提供了测定蛋白结构尤其需要的长程信息。

不同的定向介质中，RDC的具体数值会有所不同。所以要根据所考察体系的实际情况来选择相应的定向介质，为谱图解析工作提供方便。

以上两点是我的粗陋理解，如果楼主有需要，我会进一步请教实验室里的专家。另外RDC的牛人之一，University of Georgia的Prof. Jim Prestegard 5月23-25日会来我们组参加workshop,届时会做有关RDC方面的研究最新介绍。

最后附上有关RDC在测定蛋白结构方面的综述文献汇总
(Residual Dipolar Couplings in Structure
Determination – Recent Reviews)

Prestegard, A-Hashimi & Tolman, Quart. Reviews
Biophys. 33, 371-424 (2000).

Bax, Kontaxis & Tjandra, Methods in Enzymology,
339, 127-174 (2001)

Tolman, Curr. Opin. Struct. Biol. 11, 532-539 (2001)

Prestegard, Bougault & Kishore, Chemical Reviews,
104, 3519-3540 (2004)

Lipsitz & Tjandra, Ann. Rev. Biophys. Biomol. Struct.,
33, 387-413 (2004)

Fushman et al., Prog. NMR Spect. 44, 189-214 (2004)